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虽然起源问题无法直接用科学的方法重演，但科学家们仍在观察、推理的基础上，对宇宙的起源提出各种假说。现在，大爆炸论被广泛地接受。李志航博士在《科学对基督教的挑战》和梁斐生博士在《真金不怕洪炉火》两本书中，对此都有引人入胜的论述。
19世纪30年代初期，德国医生奥伯斯（Olbers）从一个简单的观察中提出宇宙不是处于衡定状态的假说。大家都知道星与星之间的夜空是完全黑暗无光的。奥伯斯首先想到，这说明宇宙中星球的数目是有限的，不能使宇宙的每个角落都发光。其次他假设，由于星球之间的万有引力，星球之间的距离会越来越小；或者由于什么尚不清楚的原因，万有引力会被抵消，使星球间的距离不断加大，即宇宙可能在膨胀。但这种假说未引起当时科学界的注意。
本世纪20年代，美国天文学家观察到了红移现象（red-shift）。他们发现距地球很远的星球或星系射到地球的光，比离地球近的星的星光弱，而且较偏红色，即偏向可见光中的长波光谱。在声学上有一种现象叫做都普勒转移（Doppler Shift）：当一个运动物体接近我们时，我们收到的它的声波频率偏高；当它远离我们而去时，我们收到的它的声波则偏向低频。一个最常见的例子是，当火车驶进站时，站在月台上的人听到它的鸣笛十分高亢；当它离站驶去时，笛声则变得低沉。因此天文学家们把红移现象解释为：远处射出红光的星球正在以高速度远离地球。
几年后，爱因斯坦于一九一七年发表了著名的普遍相对论，震动了科学界。一些科学家发现相对论的公式，包含有宇宙不恒定的结论。但爱因斯坦不同意此见解，他当时以为自己的计算有误差，于是在方程式中又加进一个常数，以抵消宇宙有不断膨胀或收缩的可能性。
一九三一年，美国天文学家哈博（Edwin Hubble）用当代最大的二百吋天文望远镜，惊奇地发现在银河系外还有千千万万个天河系，而且这些天河系明显地不断迅速向外扩张。在事实面前，爱因斯坦承认他在相对论公式中，所加的宇宙常数是他一生中最大的失误。尽管他感到有些刺激，并认为不尽合理，仍勉强地接受了「宇宙有个原始的必须性」的假说。由于理论和观察都提供了充分的证据，此后科学界再不怀疑宇宙确实是在膨胀了。
基于宇宙在不断膨胀的事实，早在40年代，旅美俄裔物理学家伽莫（George Gamow）等科学家就预测说，只有一个从近于无限高温迅速冷却的宇宙，才能合理解释质子和中子的融合，以致产生今天这个含73％的氢，24％的氦，及3％的重元素的宇宙；如果宇宙是由大爆炸产生的，在整个宇宙都以测量到绝对零度（－273℃）以上约五度的微光。5 只是，他们的预测并未引起应有的重视。当时，一般实验室没有足够精密的仪器在如此低温下来侦测这种微波。
一九六四年，美国电讯公司贝尔（Bell）研究所的两位科学家彭兹雅（Arno Penzias）和威尔逊（Robert Wilson），用一种敏感的天线装置测量银河系的电波时，记录到很多杂音。他们一直以为天线有毛病，但天线经过彻底检查，确保无误后，这些杂音仍然存在，而且从各个方向测量的结果完全一样。这种杂音的强度所代表的温度是－270℃左右。
与此同时，以狄克（R. Dicke）为首的美国普林斯顿大学的一群物理学家也在寻找太空微波。他们理论计算的结果是，如果宇宙是由大爆炸而来，其遗留的爆炸微波所代表的温度应是－263℃左右。有趣的是，这两个研究小组并不相通，而且他们都不知道伽莫等人在一九四八年所作的计算。一个偶然的机会，他们得知了彼此的研究情况，并认为彭兹雅和威尔逊接收到的杂音，正是大爆炸后余留至今的微波辐射！当他们的研究结果在天文物理学报上发表后，引起强烈震动。其他科学家随后所从事的观测和计算，也完全一样。由于这一震惊世界的发现，彭兹雅等获得一九七八年诺贝尔奖。美国太空总署发布的宇宙背景探测卫星（COBE）在大气层以上测得的数据表明，宇宙是一个完全的辐射体，与爆炸论相符。
此外，根据大爆炸理论，宇宙中最先形成的元素是原子量小于7的元素，主要是氢和氦。氢和氦在宇宙中的比例的理论推算，与现今在宇宙中测定的是吻合的。二十年来，物理学家用核子加速器研究不同核子、粒子高速碰撞的结果，用以推测宇宙形成过程中不同核子的比例，其推测结果也与今天实际观测的比例一致。
大爆炸理论是否合符客观实际，需要进一步被检验；宇宙是否有百亿年的历史，也值得商榷；该理论在细节上也存在不少问题。但因它合理地解释了宇宙的膨胀，找到了大爆炸的直接证据；加之，按此理论推算的结论和在加速器中得到的数据，大都与在宇宙中观测的实际情况相符。因此，大爆炸理论已成为现今被广泛接受的理论。
大爆炸理论的观点、推论和实际观测结果中，包含了许多奇特、不可思议和超越自然律的部分。对此，梁斐生博士在《真金不怕洪炉火》一书中有详尽论述，我这里只简要地举出几点。
第一，现在多数宇宙学家都认为，在大爆炸之前，只有虚无，连时间和空间也没有。可是，如果什么都没有，爆炸怎么会发生呢？而且，宇宙这种「无中生有」的起源是与热力学第一定律不相符的。
第二，前面提到，当一个过程处于初始阶段时，冷热不均衡，熵质很低，然后冷热趋于均匀，熵质不断增高。但英国著名天文学家彭罗斯（Roger Penrose）却提醒人们，原始爆炸的火球原是处于热膨胀平衡状态，具有极高的熵值。这又是与热力学第二定律尖锐地对立。
第三，根据宇宙新膨胀论，在大爆炸发生后的10秒的一瞬间，宇宙膨胀了十倍，其膨胀速度可高达10米／秒，远远地超越了相对论中的光速极限（3×10 米／秒）。
第四，现在大多数学者对大爆炸后10秒以后的过程，已有不少共识，但对大爆炸后10秒之内的情况，却根本无法窥测。因为在这段时间内，温度极高，可达10℃，一切自然律都失去了功效。换句话说，宇宙是在超自然的状况中产生的。
另外，我们一般人都会认为，如此剧烈大爆炸的结果，一定是杂乱无章的，就像炸弹的爆炸一样。然而实际情况却大出人的预料。美国太空总署为侦测大爆炸遗留的背景微波辐射，而特别发射的卫星，于一九八九年十一月升空后，两年内收集到的数据表明，宇宙每一个方向的背景温度完全一致，只相差万分之一凯尔温度！到一九九二年，科学家从该卫星收集到的几亿个测量数据中发现，它们只相差万分之三度！也就是说，大爆炸所产生的微波细浪是出奇地均匀、平滑！这是大大超乎人们的想象的。更奇妙的是，正是从这极微小的不均匀中，各种元素、星云、星系得以产生，形成今日的宇宙！
加拿大天文学家罗斯（Hugh Ross）指出：科学家们发现，在宇宙中形成生命所需的必须物质，宇宙中的很多特征一定要被精细微调。他在书中列举了人们已发现的二十五种特征。这些特征之精确，使人瞠目。比如，宇宙的膨胀率不能与现今的膨胀率相差10分之一！又比如，宇宙中电子与质子数目相等的精确度是10分之一，否则宇宙的电磁力就将克服各种引力，使星体不能形成。10 7 分之一是什么概念呢？罗斯有个形像的比喻。把十亿个北美洲大小的面积铺上一角钱的硬币，从地球一直铺到月亮那么高，其硬币的总数就约为10 7。把其中一个硬币涂上红漆后，再混到硬币堆里去。在这个堆里找到这枚红漆硬币的可能性就是10 7 分之一！随着对宇宙精妙的不断认识，科学家们不能不面对科学的创造者。「某人精调大自然」、「超智慧」、「耍弄」、「无可抗拒的设计」、「上帝的手」、「最终目的」、「上帝的思想」、「优美的秩序」、「非常精密的平衡」、「超然聪颖」、「超自然结构」、「超自然机制」、「合身裁剪」、「超然存在者」、「神工斧凿」等等，已成为天文学家们描述这位造物主的常用语。宇宙必有一个开始，一个超越自然律的开始。这个结论与进化的模式无法协调，却与神创造宇宙的创造模式完全吻合。
笔者过去以为，并相信现在很多学生、学者仍然以为，科学研究的结果是最客观、可靠的，因为科学家是不偏不倚、完全公允地从实验、观测数据中得出结论的。可惜，事实并非如此。这里姑且不论那些不时被曝光的伪造实验数据的丑闻。对一般科学家而言，由于世界观和信仰不同，在科学研究中总会有意无意地、或多或少地重视或偏爱自己所预期的结果，会接受和坚持那些证据并不十分充分、但符合自己世界观和信仰的假说或理论。真正要做到客观、公正，敢于在真实面前修正自己的观点是相当不容易的。这在宇宙起源的研究中也看得很清楚。
不少受人文主义影响的科学家坚持宇宙永恒、自然演化的无神论观点。在红移现象被发现、推测宇宙在不断膨胀的假说提出后不久，爱因斯坦推出相对论。当别人指出相对的公式中含有宇宙膨胀结论时，爱因斯坦不接受，以为自己的计算有误，所以特别引进一个宇宙常数，以消除宇宙膨胀或收缩的可能性。虽然现在有些科学家认为，作为一种反重力的因素，爱因斯坦的这个宇宙常数是可能存在的（参见《Reason’s to Believe》, Third Quarter/1999, Vol/1 No/3, P.3），但当年爱因斯坦加上这一宇宙常数，并非出于科学的洞见，而是信仰的支配。因为他不愿意相信宇宙有个开始。所以，在他公开承认失误，接受了宇宙在膨胀、宇宙必有个开始后，心里仍感到别扭。他在和朋友的通信中说：「宇宙膨胀之说，对我有点刺激。」「承认这些证据的可能性，似乎不合理。」不过，这位科学巨匠是值得钦佩的，他毕竟有承认错误的勇气。
宇宙膨胀获得充分证据后，伽莫等科学家早在本世纪40年代就提出大爆炸论的假说，但不受科学界青睐。一九四八年，三位英国天文物理学家邦迪（Herman Bondi）、高特（Thomas Gold）和荷尔（Fred Hoyle）提出宇宙衡态论（Steady State），认为宇宙虽在膨胀，但宇宙可以从一个尚不知晓的地方，不断产生新物质（可能是氢），以填补宇宙膨胀后留下的空间，使宇宙的平均密度保持不变。此假说并无充分的事实依据，但因它既能解释宇宙的膨胀这个事实，又表明宇宙不需要有个开始，因此立即获得科学界的广泛支持。可见，世界观有时比事实更重要。
现在，大爆炸理论已站住脚跟，衡态论已失去优势，但仍有科学家不愿接受宇宙有个开始的结论。于是又有人提出一种新的假说，循环论（Oscillating Theory）。这个假说承认宇宙是由大爆炸而来，宇宙在膨胀之中；但由于万有引力，有一天宇宙不再膨胀，进而开始收缩，密度和温度不断增高后，复变成原始火球，于是又发生大爆炸。如此膨胀、收缩，周而复始，所以宇宙仍然不需要有开始。循环论也并没有什么事实根据。李志航在《科学对基督教的挑战》一书中指出，循环论面对两大难题。第一，除非宇宙的物质再增加十倍，否则没有足够的万有引力可以阻止宇宙的膨胀。第二，根据物理学和热力学的理论计算，如果宇宙真有不断膨胀收缩的周期，每一周期中光子对核子的比例会越来越大；如果宇宙无尽地膨胀──收缩循环，今天光子对核子的比例应是无限大，但这显然与事实不符。
当然，也确有不少科学家在研究宇宙起源中进一步认识了神。因发现大爆炸余留的微波辐射而获得诺贝尔奖的彭兹雅（Penzias）就公开表示。《圣经》的记载和当前天文学最佳的科学左证不谋而合。当美国著名的劳伦斯‧巴克莱（Lawrence Ber-kely）实验室的科学家，于一九九二年发现大爆炸遗留的微波辐射是那样均匀雅致，那样精美绝伦时，他们说这好像是亲眼看到了神一样！如第五章所述，戴维斯（Paul Davies）、荷尔（Fred Hoyle）等科学家的无神论世界观正在改变之中。神一直借着《圣经》和大自然向人们启示祂自己，凡真诚寻求真理的科学家都能认识祂。